Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F11rO88792 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F11rO88792 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F11rO88792 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F11rO88792 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F11rO88792 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F11rO88792 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
F11rO88792 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
F11rO88792 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F11rO88792 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F11rO88792 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F11rO88792 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F11rO88792 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F11rO88792 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F11rO88792 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F11rO88792 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F11rO88792 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F11rO88792 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F11rO88792 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F11rO88792 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F11rO88792 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F11rO88792 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F11rO88792 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F11rO88792 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms