Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnal1O88327 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnal1O88327 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnal1O88327 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnal1O88327 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms