Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Nid2O88322 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nid2O88322 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Nid2O88322 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Nid2O88322 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nid2O88322 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Nid2O88322 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Nid2O88322 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Nid2O88322 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Nid2O88322 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nid2O88322 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,2 ms