Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HcrtO55241 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HcrtO55241 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HcrtO55241 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HcrtO55241 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HcrtO55241 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HcrtO55241 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HcrtO55241 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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