Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbnO55189 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbnO55189 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbnO55189 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbnO55189 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmbnO55189 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmbnO55189 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbnO55189 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AmbnO55189 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbnO55189 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AmbnO55189 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AmbnO55189 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmbnO55189 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmbnO55189 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms