Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nck2O55033 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nck2O55033 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nck2O55033 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nck2O55033 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nck2O55033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nck2O55033 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nck2O55033 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nck2O55033 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nck2O55033 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms