Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3O55013 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc3O55013 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3O55013 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms