Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs5O54928 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs5O54928 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs5O54928 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs5O54928 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs5O54928 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs5O54928 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs5O54928 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Socs5O54928 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Socs5O54928 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs5O54928 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs5O54928 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Socs5O54928 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs5O54928 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs5O54928 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Socs5O54928 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163 ms