Protein–RNA interactions for Protein: O54714

Pias3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias3O54714 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pias3O54714 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pias3O54714 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pias3O54714 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pias3O54714 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pias3O54714 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pias3O54714 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pias3O54714 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pias3O54714 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pias3O54714 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pias3O54714 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pias3O54714 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pias3O54714 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias3O54714 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms