Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CaluO35887 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CaluO35887 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CaluO35887 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaluO35887 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CaluO35887 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CaluO35887 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaluO35887 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaluO35887 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaluO35887 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaluO35887 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaluO35887 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CaluO35887 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaluO35887 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaluO35887 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CaluO35887 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaluO35887 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaluO35887 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaluO35887 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaluO35887 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaluO35887 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CaluO35887 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CaluO35887 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaluO35887 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CaluO35887 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaluO35887 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CaluO35887 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CaluO35887 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CaluO35887 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CaluO35887 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaluO35887 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CaluO35887 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CaluO35887 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CaluO35887 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CaluO35887 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CaluO35887 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CaluO35887 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CaluO35887 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CaluO35887 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CaluO35887 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CaluO35887 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CaluO35887 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CaluO35887 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CaluO35887 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaluO35887 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaluO35887 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaluO35887 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CaluO35887 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CaluO35887 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaluO35887 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CaluO35887 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms