Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phox2bO35690 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phox2bO35690 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phox2bO35690 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms