Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag2O35638 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag2O35638 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stag2O35638 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag2O35638 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag2O35638 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stag2O35638 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag2O35638 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag2O35638 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag2O35638 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag2O35638 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag2O35638 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag2O35638 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms