Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn6O35454 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn6O35454 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms