Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dgcr6O35347 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dgcr6O35347 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms