Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srsf5O35326 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srsf5O35326 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srsf5O35326 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms