Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Polr1aO35134 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Polr1aO35134 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Polr1aO35134 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Polr1aO35134 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Polr1aO35134 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms