Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec22bO08547 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec22bO08547 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22bO08547 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22bO08547 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 902 ms