Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al1oL7MU04 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1oL7MU04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms