Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3402K7N5P2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3402K7N5P2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3402K7N5P2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3402K7N5P2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3402K7N5P2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3402K7N5P2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3402K7N5P2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms