Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccer2J3QPU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccer2J3QPU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccer2J3QPU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccer2J3QPU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccer2J3QPU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms