Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim22J3QP37 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim22J3QP37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smim22J3QP37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms