Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16427J3QN52 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm16427J3QN52 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16427J3QN52 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms