Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim55G3X8Y1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim55G3X8Y1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim55G3X8Y1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms