Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2210016F16RikG3X8U3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210016F16RikG3X8U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms