Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms