Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
BC005561E9Q5E2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BC005561E9Q5E2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BC005561E9Q5E2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BC005561E9Q5E2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BC005561E9Q5E2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
BC005561E9Q5E2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms