Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230217C12RikE9Q3Z1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230217C12RikE9Q3Z1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230217C12RikE9Q3Z1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms