Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16,21■□□□□ 0,19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16,21■□□□□ 0,19
6430550D23RikE9Q1X6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
6430550D23RikE9Q1X6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,15■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,15■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16,14■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,14■□□□□ 0,18
6430550D23RikE9Q1X6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16,1■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
6430550D23RikE9Q1X6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16,08■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,08■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16,07■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
6430550D23RikE9Q1X6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms