Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd2E9Q1M1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd2E9Q1M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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