Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ift140E9PY46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ift140E9PY46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ift140E9PY46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ift140E9PY46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ift140E9PY46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms