Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430403G16RikD3Z5L4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
5430403G16RikD3Z5L4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430403G16RikD3Z5L4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms