Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930467E23RikD3Z1P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms