Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc11B2RXC1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc11B2RXC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc11B2RXC1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms