Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf3B2RUQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usf3B2RUQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms