Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf1B2RRD7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf1B2RRD7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brpf1B2RRD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms