Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1B2KF50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms