Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CK137956B1AYM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CK137956B1AYM9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CK137956B1AYM9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms