Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt3B0QZW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt3B0QZW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt3B0QZW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt3B0QZW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms