Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrA6H5Y3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrA6H5Y3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrA6H5Y3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrA6H5Y3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms