Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc9bA3KGF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc9bA3KGF9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc9bA3KGF9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms