Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Palm3A2TJV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palm3A2TJV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Palm3A2TJV2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Palm3A2TJV2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Palm3A2TJV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Palm3A2TJV2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Palm3A2TJV2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms