Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SktA2AQ25 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SktA2AQ25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SktA2AQ25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SktA2AQ25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SktA2AQ25 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SktA2AQ25 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms