Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prdm16A2A935 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Prdm16A2A935 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Prdm16A2A935 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prdm16A2A935 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm16A2A935 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm16A2A935 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm16A2A935 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms