Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo47A2A6H3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo47A2A6H3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms