Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Akap17bA2A3V1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Akap17bA2A3V1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Akap17bA2A3V1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms