Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cc2d2bA0A286YDU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cc2d2bA0A286YDU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cc2d2bA0A286YDU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cc2d2bA0A286YDU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms