Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16,94■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Trdv1A0A075B657 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16,85■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,29
Trdv1A0A075B657 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms