Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms