Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms