Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms